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德州驢基因組成功破譯 家驢的祖先找到了

時間:2020-12-15 08:21:26    來源:科技日報    

12月9日,《自然》子刊《自然·通訊》發(fā)表了中國科研團隊的一篇遺傳學(xué)研究論文。中國科學(xué)家聯(lián)合國內(nèi)外多家單位,成功破譯了德州驢基因組,獲得國際首個組裝到染色體水平的家驢基因組參考圖譜。

作為中國五大優(yōu)良驢種之一,德州驢個體大、皮厚、出膠率高,是熬制阿膠的上等原料。

為深入挖掘德州驢的遺傳資源,山東省農(nóng)科院聯(lián)合東阿阿膠股份有限公司于2014年底聯(lián)合發(fā)起了“德州驢基因組開發(fā)及其產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用”項目,經(jīng)過5年多不懈攻關(guān),最終構(gòu)建了德州驢染色體水平的高質(zhì)量參考基因組圖譜。

家驢的起源與馴化歷史一直以來存在爭議。該研究團隊采集了9個國家的126頭家驢、1頭非洲野驢和6頭亞洲野驢樣品,通過全基因組重測序檢測了大量的基因組遺傳變異。通過系統(tǒng)進化分析和主成分分析,可以明確世界上所有家驢均起源于非洲野驢。種群遺傳關(guān)系分析進一步表明熱帶非洲家驢群體與非洲野驢關(guān)系更緊密,埃及家驢群體次之,這表明家驢可能馴化于熱帶非洲,隨后通過埃及擴散到歐洲、中亞及東亞。

該團隊發(fā)現(xiàn)家驢在演化早期具有與非洲野驢相似的種群變化歷史,而家驢在從非洲野驢中分離出來后,不同群體間仍然具有高度相似的種群演化歷史,說明家驢的起源比較單一。

父系遺傳物質(zhì)和母系遺傳物質(zhì)對于群體演化歷史研究具有重要的價值,研究團隊成功組裝了家驢的Y染色體并構(gòu)建了家驢群體父系遺傳物質(zhì)的系統(tǒng)進化樹,同時根據(jù)線粒體變異位點構(gòu)建了母系遺傳物質(zhì)的系統(tǒng)進化樹。發(fā)現(xiàn)母系遺傳物質(zhì)中除了索馬里野驢成分外還可能存在努比亞野驢成分,父系遺傳物質(zhì)可能在馴化過程中受到人類喜好的影響只來自于少數(shù)幾個雄性個體。

德州驢基因組不僅為馬屬動物的起源進化研究提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ),也為優(yōu)良遺傳資源保護和利用、家驢基因組選擇育種和遺傳改良、家驢分子設(shè)計育種提供了數(shù)據(jù)支撐。(記者王延斌通訊員張偉)

關(guān)鍵詞: 家驢的祖先

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