德州驢基因組成功破譯 家驢的祖先找到了

12月9日，《自然》子刊《自然·通訊》發(fā)表了中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)的一篇遺傳學(xué)研究論文。中國(guó)科學(xué)家聯(lián)合國(guó)內(nèi)外多家單位，成功破譯了德州驢基因組，獲得國(guó)際首個(gè)組裝到染色體水平的家驢基因組參考圖譜。

作為中國(guó)五大優(yōu)良驢種之一，德州驢個(gè)體大、皮厚、出膠率高，是熬制阿膠的上等原料。

為深入挖掘德州驢的遺傳資源，山東省農(nóng)科院聯(lián)合東阿阿膠股份有限公司于2014年底聯(lián)合發(fā)起了“德州驢基因組開發(fā)及其產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用”項(xiàng)目，經(jīng)過5年多不懈攻關(guān)，最終構(gòu)建了德州驢染色體水平的高質(zhì)量參考基因組圖譜。

家驢的起源與馴化歷史一直以來存在爭(zhēng)議。該研究團(tuán)隊(duì)采集了9個(gè)國(guó)家的126頭家驢、1頭非洲野驢和6頭亞洲野驢樣品，通過全基因組重測(cè)序檢測(cè)了大量的基因組遺傳變異。通過系統(tǒng)進(jìn)化分析和主成分分析，可以明確世界上所有家驢均起源于非洲野驢。種群遺傳關(guān)系分析進(jìn)一步表明熱帶非洲家驢群體與非洲野驢關(guān)系更緊密，埃及家驢群體次之，這表明家驢可能馴化于熱帶非洲，隨后通過埃及擴(kuò)散到歐洲、中亞及東亞。

該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)家驢在演化早期具有與非洲野驢相似的種群變化歷史，而家驢在從非洲野驢中分離出來后，不同群體間仍然具有高度相似的種群演化歷史，說明家驢的起源比較單一。

父系遺傳物質(zhì)和母系遺傳物質(zhì)對(duì)于群體演化歷史研究具有重要的價(jià)值，研究團(tuán)隊(duì)成功組裝了家驢的Y染色體并構(gòu)建了家驢群體父系遺傳物質(zhì)的系統(tǒng)進(jìn)化樹，同時(shí)根據(jù)線粒體變異位點(diǎn)構(gòu)建了母系遺傳物質(zhì)的系統(tǒng)進(jìn)化樹。發(fā)現(xiàn)母系遺傳物質(zhì)中除了索馬里野驢成分外還可能存在努比亞野驢成分，父系遺傳物質(zhì)可能在馴化過程中受到人類喜好的影響只來自于少數(shù)幾個(gè)雄性個(gè)體。

德州驢基因組不僅為馬屬動(dòng)物的起源進(jìn)化研究提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)，也為優(yōu)良遺傳資源保護(hù)和利用、家驢基因組選擇育種和遺傳改良、家驢分子設(shè)計(jì)育種提供了數(shù)據(jù)支撐。(記者王延斌通訊員張偉)

關(guān)鍵詞： 家驢的祖先