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研究:幾近完整的高質(zhì)量草莓參照基因組公布

時(shí)間:2019-02-26 15:51:21    來(lái)源:科技日?qǐng)?bào)    

據(jù)英國(guó)《自然·遺傳學(xué)》雜志25日在線發(fā)表的一項(xiàng)研究,美國(guó)科學(xué)家報(bào)告了一個(gè)幾近完整的草莓參照基因組。該高質(zhì)量基因組不但為了解草莓起源和演化歷史提供了新見(jiàn)解,還對(duì)未來(lái)改善其品種及提高抗病性大有助力。

八倍體栽培種草莓卡姆羅莎有8組染色體,也被稱為花園草莓,因其味美清香而深受喜愛(ài)。

此次,美國(guó)密歇根州立大學(xué)研究人員帕德里克·艾德格及其同事,對(duì)該八倍體草莓的基因組進(jìn)行了高質(zhì)量組裝和注釋,共鑒定出10萬(wàn)多個(gè)草莓基因。研究團(tuán)隊(duì)對(duì)草莓屬二倍體種(擁有兩組染色體的草莓品種)的31組RNA分子進(jìn)行了測(cè)序,并將二倍體種的表達(dá)基因序列與八倍體栽培種草莓的表達(dá)基因序列進(jìn)行了對(duì)比。

研究團(tuán)隊(duì)隨后通過(guò)演化分析,鑒定出了森林草莓、飯沼草莓以及此前未知的綠色草莓和日本草莓,是八倍體栽培種草莓的4個(gè)二倍體祖先種。該分析結(jié)合現(xiàn)存種的地理分布還可以表明,八倍體草莓起源于北美。

除此之外,團(tuán)隊(duì)還對(duì)八倍體草莓的4個(gè)亞基因組開(kāi)展了演化動(dòng)力學(xué)分析,他們發(fā)現(xiàn)了一個(gè)占支配地位的亞基因組,能在很大程度上控制草莓的代謝和抗病性狀。

研究人員總結(jié)表示,草莓的演化和起源信息、占主導(dǎo)地位的亞基因組,以及首個(gè)八倍體草莓高質(zhì)量基因組,未來(lái)能作為研究人員和育種者改善栽培種花園草莓口味、香味和提高抗病性的有利資源。(張夢(mèng)然)

關(guān)鍵詞: 草莓 基因組

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